En 642, le temple Zenko-ji a été fondé lorsque l'une des premières statues bouddhistes du Japon, ramenée de la péninsule coréenne, a été consacrée sur le site. Aujourd'hui, le temple est l'un des sites bouddhistes les plus importants du pays, ainsi que la troisième plus grande structure en bois du Japon, avec toute la ville de Nagano construite autour de lui.
La structure telle qu'elle se présente aujourd'hui remonte à 1707 et contient une grande salle affichant une variété de statues bouddhistes, un autel principal et un passage souterrain sous l'autel où les visiteurs peuvent passer dans l'obscurité complète, en cherchant une seule clé sur le mur - la clé du paradis - qui est considérée comme un grand salut pour quiconque la touche.
Derrière le temple principal, une pagode plus récente abrite le musée d'histoire Zenko-ji avec sa collection de statues du Bouddha et de ses disciples.