L'isola Elefantina è il sito dell'antica Abu (che significa sia elefante che avorio nell'antico Egitto), entrambi i nomi ricordano l'importante commercio di avorio dell'isola. All'inizio della I dinastia (circa 3.000 a.C.) sull'isola fu costruita una fortezza per stabilire la frontiera meridionale dell'Egitto. Abu divenne presto un importante punto doganale e centro commerciale. Rimase strategicamente significativo per tutto il periodo faraonico come punto di partenza per le spedizioni militari e commerciali in Nubia e nel sud. Durante la VI dinastia (2345-2181 a.C.) Abu crebbe come centro politico ed economico e, nonostante i periodici alti e bassi, l'isola mantenne la sua importanza fino al periodo greco-romano.
Oltre ad essere un fiorente insediamento, Elefantina era il principale centro di culto del dio dalla testa di ariete Khnum (inizialmente il dio dell'inondazione, e dalla XVIII dinastia adorato come il creatore dell'umanità sul suo tornio da vasaio), Satet (Khnum's moglie e guardiana della frontiera meridionale) e la loro figlia Anket. Ogni anno lo scrosciare delle acque del diluvio fu sentito per la prima volta qui su Elefantina. Nel corso del tempo i complessi religiosi hanno occupato sempre più l'isola, quindi le aree residenziali si sono spostate più a nord dell'isola o sulla riva orientale. La città tempio di Abu ricevette il suo colpo di grazia nel IV secolo d.C., quando il cristianesimo fu stabilito come religione imperiale romana. Da quel momento in poi, il culto degli antichi dei fu gradualmente abbandonato e le fortificazioni difensive furono spostate sulla riva orientale, l'odierna città di Assuan.