Nell'anno 642, il tempio Zenko-ji fu fondato quando una delle prime statue buddiste in Giappone, portate dalla penisola coreana, fu custodita nel sito. Oggi, il tempio è uno dei siti buddisti più importanti del paese, nonché la terza struttura in legno più grande del Giappone, con l'intera città di Nagano costruita intorno ad esso.
La struttura così com'è oggi risale al 1707 e contiene una grande sala che mostra una varietà di statue buddiste, un altare principale e un passaggio sotterraneo sotto l'altare dove i visitatori possono passare nella completa oscurità, sentendo un'unica chiave sul muro - la chiave del paradiso - che è creduto alla grande salvezza per chiunque lo tocchi.
Dietro il tempio principale, una nuova pagoda ospita il Museo di storia Zenko-ji con la sua collezione di statue del Buddha e dei suoi discepoli.